Что можно делать на ru.bezoder.com - Безодер sky
Дата публикации:
17 сен 2020
Автор: Миша Трунов

Что можно делать на ru.bezoder.com?

Генетические тесты набирают популярность. Сдав тест, можно получить огромное количество информации о своем теле и своем происхождении. Тем не менее, часть этой информации предоставляется в виде некоторого кода.

ru.bezoder.com создан для того, чтобы превращать этот не всегда понятный простому человеку код в описание свойств его организма и, возможно, рекомендации, как повысить шансы на избежание той или иной болезни.

Рассмотрим пример:

в файле с необработанными данными со многих сервисов генетического тестирования можно найти такую строку:

...

rs5082 1 161193683 GG

...

В разных сервисах строка может иметь немного другой формат - комбинации могут быть разделены не пробелами как выше, а запятыми или взяты в кавычки. Сути это не поменяет. Данная строка и есть тот самый код, о котором упомянуто выше.

Что же означают комбинации в строке? Первая комбинация rs5082 это номер однонуклеотидного полиморфизма (ОНП или SNP на английском), цифра 1 означает хромосому, на которой находится ОНП, следующая длинная цифра 161193683 это позиция нашего ОНП на хромосоме - первой хромосоме, как уже было выяснено, и, наконец последняя комбинация GG называется генотип - это то, что находится в rs5082 для тестируемого.

Что-то прояснилось, но как же мы перейдем к свойствам организма или к рекомендациям? Давайте внимательно посмотрим на две статьи 2009 и 2010 годов. В этих статьях ученые из США, Испании и Сингапура совместно выяснили, что обладатели GG в rs5082 худеют, если употребляют меньше насыщенных жиров. И тут, вы, возможно скажите - "это и так ясно - чем меньше я ем жиров, тем активнее я худею" и будете правы, но давайте взглянем на график из статьи:

https://storage.googleapis.com/ru-bezoder-media/images/APOA2.width-500.png
Зависимость между индексом массы тела (вертикальная ось) и дневным потреблением насыщенных жиров в граммах в день (горизонтальная ось)

На графике две прямые обозначенные CC и TT+TC. Не вдаваясь в подробности, GG из нашей строки это CC на этом графике. Если бы в нашей строке было AA или AG то это бы соответствовало TT+TC на графике. По оси y отложен индекс массы тела - это величина, характеризующая насколько человек толстый или худой - учитывает рост и вес. По оси x на графике отложена количество потребляемого насыщенного жира в граммах в день.

И что же получается из графика - люди, у которых GG в rs5082 будут активнее худеть, если ограничат дневное употребление жира, тогда как те, у которых в rs5082 AA или AG если и снизят свой вес, то очень незначительно при малом потреблении насыщенных жиров.

Не будем вдаваться в подробности исследований и детали графика - этот пост не об этом. Мы только что выяснили, как превратить информацию из rs5082 в конкретное описание особенностей любого человека.

Файлы генетических тестов обычно содержат более 600 тысяч строк, подобных рассмотренной нами строки. Более того, некоторые ОНП могут отвечать сразу за несколько свойств. Например, недавно выяснилось, что ОНП, ассоциирующийся с болезнью Альцгеймера также ассоциируется с тяжестью протекания коронавируса Covid-19. Практически каждый день публикуются статьи, в которых ученые открывают новые зависимости между свойствами и различными ОНП.

Какова роль ru.bezoder.com? На данном сайте Вы можете как смотреть свои результаты, вычисленные на основе Ваших генетических данных для различных свойств, так и создавать шаблоны свойств на основе научных статей или других достоверных источников.